MEME version 4.4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies (from meme_chip/background): A 0.30000 C 0.20000 G 0.20000 T 0.30000 MOTIF Beaf-32 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 285 E= 3.3e-230 0.182456 0.249123 0.007018 0.561404 0.842105 0.000000 0.052632 0.105263 0.000000 0.108772 0.000000 0.891228 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.800000 0.000000 0.056140 0.143860 0.157895 0.059649 0.564912 0.217544 0.021053 0.435088 0.136842 0.407018 MOTIF CTCF letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 189 E= 8.2e-197 0.412698 0.370370 0.164021 0.052910 0.105820 0.407407 0.026455 0.460317 0.920635 0.000000 0.037037 0.042328 0.058201 0.000000 0.925926 0.015873 0.476190 0.015873 0.507937 0.000000 0.000000 0.037037 0.185185 0.777778 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.010582 0.000000 0.941799 0.047619 0.121693 0.862434 0.000000 0.015873 0.000000 0.000000 0.947090 0.052910 0.037037 0.777778 0.047619 0.137566 MOTIF GAATAGAAA letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 30 E= 6.2e+018 0.100000 0.666667 0.033333 0.200000 0.166667 0.000000 0.766667 0.066667 0.766667 0.000000 0.000000 0.233333 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.033333 0.000000 0.966667 0.833333 0.000000 0.133333 0.033333 0.200000 0.000000 0.733333 0.066667 0.933333 0.000000 0.000000 0.066667 0.933333 0.000000 0.066667 0.000000 0.800000 0.000000 0.000000 0.200000 MOTIF GAF letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 443 E= 4.0e-566 0.000000 0.769752 0.126411 0.103837 0.000000 0.221219 0.119639 0.659142 0.013544 0.787810 0.033860 0.164786 0.042889 0.049661 0.205418 0.702032 0.000000 0.878104 0.000000 0.121896 0.047404 0.067720 0.205418 0.679458 0.011287 0.916479 0.000000 0.072235 0.022573 0.004515 0.115124 0.857788 0.004515 0.948081 0.013544 0.033860 0.020316 0.004515 0.009029 0.966140 0.013544 0.717833 0.020316 0.248307 MOTIF Ibf letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 340 E= 3.4e-190 0.323529 0.338235 0.105882 0.232353 0.794118 0.014706 0.191176 0.000000 0.091176 0.023529 0.000000 0.885294 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.929412 0.070588 0.000000 0.000000 0.550000 0.000000 0.420588 0.029412 0.994118 0.000000 0.005882 0.000000 0.770588 0.038235 0.091176 0.100000 0.329412 0.000000 0.058824 0.611765 MOTIF Ohler-1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 519 E= 6.0e-1012 0.102119 0.614644 0.061657 0.221580 0.799615 0.009634 0.152216 0.038536 0.071291 0.001927 0.926782 0.000000 0.102119 0.019268 0.013487 0.865125 0.050096 0.003854 0.946050 0.000000 0.028902 0.011561 0.034682 0.924855 0.001927 0.007707 0.938343 0.052023 0.786127 0.048170 0.163776 0.001927 0.026975 0.963391 0.000000 0.009634 0.005780 0.965318 0.000000 0.028902 0.393064 0.042389 0.541426 0.023121 MOTIF Ohler-5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 69 E= 1.1e-022 0.913043 0.000000 0.086957 0.000000 0.753623 0.000000 0.057971 0.188406 0.000000 0.927536 0.072464 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.086957 0.043478 0.000000 0.869565 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 MOTIF Ohler-6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 67 E= 4.0e-010 0.537313 0.000000 0.343284 0.119403 0.805970 0.000000 0.164179 0.029851 0.910448 0.000000 0.014925 0.074627 0.656716 0.000000 0.000000 0.343284 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.835821 0.000000 0.164179 0.656716 0.059701 0.283582 0.000000 0.537313 0.179104 0.268657 0.014925 MOTIF Ohler-8 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 18 E= 2.4e-012 0.000000 0.055556 0.000000 0.944444 0.000000 0.000000 0.944444 0.055556 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.944444 0.055556 0.000000 0.000000 0.888889 0.000000 0.111111 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.111111 0.000000 0.888889 0.000000 0.000000 0.944444 0.055556 0.000000 0.000000 0.722222 0.277778 0.000000 MOTIF Pita letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 114 E= 1.1e-093 0.719298 0.000000 0.236842 0.043860 0.000000 0.035088 0.894737 0.070175 0.964912 0.000000 0.026316 0.008772 0.000000 0.982456 0.000000 0.017544 0.508772 0.096491 0.105263 0.289474 0.131579 0.780702 0.017544 0.070175 0.578947 0.149123 0.271930 0.000000 0.859649 0.078947 0.026316 0.035088 0.929825 0.035088 0.026316 0.008772 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 MOTIF Su(Hw) letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 175 E= 3.8e-208 0.805714 0.017143 0.085714 0.091429 0.960000 0.011429 0.022857 0.005714 0.885714 0.000000 0.051429 0.062857 0.062857 0.017143 0.862857 0.057143 0.005714 0.045714 0.000000 0.948571 0.942857 0.011429 0.045714 0.000000 0.000000 0.005714 0.205714 0.788571 0.045714 0.000000 0.954286 0.000000 0.000000 0.988571 0.000000 0.011429 0.582857 0.097143 0.011429 0.308571 MOTIF Su(Hw)_short letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 272 E= 1.9e-310 0.955882 0.018382 0.022059 0.003676 0.882353 0.000000 0.029412 0.088235 0.066176 0.044118 0.819853 0.069853 0.000000 0.036765 0.000000 0.963235 0.941176 0.000000 0.055147 0.003676 0.003676 0.000000 0.194853 0.801471 0.022059 0.000000 0.977941 0.000000 0.000000 0.959559 0.000000 0.040441 MOTIF ZIPIC letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 262 E= 1.5e-290 0.085846 0.688963 0.120261 0.104930 0.000938 0.833031 0.054405 0.111625 0.989488 0.000970 0.008604 0.000938 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.026718 0.022901 0.851145 0.099237 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.206107 0.648855 0.015267 0.129771 0.000000 0.041985 0.034351 0.923664 0.080153 0.030534 0.889313 0.000000 0.076336 0.633588 0.255725 0.034351 MOTIF Zw5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 87 E= 3.1e-098 0.000000 0.080460 0.896552 0.022989 0.034483 0.390805 0.022989 0.551724 0.022989 0.000000 0.977011 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.816092 0.114943 0.057471 0.011494 0.000000 0.034483 0.000000 0.965517 0.034483 0.000000 0.954023 0.011494 0.057471 0.137931 0.701149 0.103448 0.000000 0.908046 0.000000 0.091954 0.724138 0.045977 0.045977 0.183908 0.712644 0.080460 0.137931 0.068966 MEME version 4.11.1 ALPHABET "DNA" DNA-LIKE strands: + - Background letter frequencies (from dataset): A 0.311 C 0.187 G 0.191 T 0.311 MOTIF Ohler-8_dreme # Word RC Word Pos Neg P-value E-value # BEST GYTGCCA TGGCARC 71 7 1.0e-015 2.8e-011 # GTTGCCA TGGCAAC 42 5 6.0e-009 1.7e-004 # GCTGCCA TGGCAGC 34 3 3.7e-008 1.0e-003 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 84 E= 2.8e-011 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.452381 0.000000 0.547619 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000